生物信息与系统生物学系

简要介绍

2002年9月,我校经教育部高等教育司批准建立“国家生命科学与技术人才培养基地”,专业为“生物信息技术”,后经教育部规范学科命名,统一名称为“生物信息学”,为国内首批开设此专业的学校。该基地方向特色是多学科交叉的生物信息技术,培养德智体全面发展、面向国家重大需求、适合当代生命科学研究和产业发展需要、具有多学科复合型知识结构和创新能力的优秀人才,至今已培养18届1000余名本科毕业生。

在逐步的教学改革与实践过程中,针对社会需求,强化主动学习、主动实践和创新能力的人才培养模式,建立了教育部人才培养模式创新区,并且与华大基因合作建设“华大基因班”,在国内外逐步形成了生命科学与信息技术相结合办学特色。以生物信息技术为特色的“国家生命科学与技术人才培养基地” 在教育部组织的评估中连续3次被评为“优秀基地”,培养的学生得到了国际国内的普遍认可。

此外,“湖北省生物信息与分子成像重点实验室”自2004年成立以来,聚焦生命医学关键科学问题所牵引的生物信息学及分子成像技术方面的科学问题、原理及相关方法研究,为重大疾病诊断及治疗研究提供新的解决手段,以满足科学前沿与国家人口与健康的重大需求。实验室在发展的过程中,主持和承担多项国家级重点重大项目,包括国家973项目、国家重大科学仪器开发专项、国家863计划、国家重大研发计划专项、国家基金委重点项目及国际合作等。取得了一批原创性研究成果,在生物信息数据挖掘、显微光学成像技术和光学生物分子标记等方面取得重大突破,特别是脑神经连接的高分辨光学成像居世界领先地位,已实现从组织器官到细胞水平、及活体动物,形态成像到功能机制研究的跨越式发展。

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主要成员

刘笔锋

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博士、华中科技大学生命科学与技术学院教授、华中卓越学者特聘教授、博士生导师,长期从事微流控芯片与微纳尺度生物医学检验技术研究,从系统生物医学角度建立高通量、精准、快速和高灵敏的分析新平台;先后主持国家973、863和国家重点研发计划课题、国家自然科学基金项目等20余项,在国际学术期刊 Adv. Mater., Nature Communications, Angew. Chem. Int. Ed., Adv. Funct. Mater., Nano Today, Anal. Chem., Lab Chip, Biosensors & Bioelectronics等发表论文SCI论文200余篇,兼任Mass Spectrometry Reviews, Journal of Separation Sciences和分析科学学报编委、中国色谱学会理事、中国仪器仪表学会样品制备专业委员会委员、中国生物医学光子学专业委员会委员、中国生物工程学会生物传感、生物芯片与纳米生物技术分会委员、2014国际微流控芯片与纳微尺度生物分离分析学术会议主席、第九届全国微全分析系统学术会议主席、第四届全国微纳尺度生物分离分析学术会议主席等。

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宁康

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宁康,华中科技大学生命科学与技术学院教授,博士生导师,生物信息与系统生物学系系主任,华中卓越学者特聘教授,湖北省楚天学者特聘教授。2003年本科毕业于中国科学技术大学计算机科学技术专业,2008年博士毕业于新加坡国立大学生物信息学专业,2010年于美国密歇根大学医学院完成博士后研究工作回国。研究重点方向为生物大数据和微生物组的挖掘及其在健康与环境等领域的应用。2015年与同仁在华中科技大学生命科学与技术学院建立生物信息与系统生物学系,建立了“生命科学大数据高性能计算平台”、“华中科技大学鄂州工业技术研究院生物大数据中心”等多个中心和平台。

在生物信息学领域从事科研工作10余年,目前主持国家自然科学基金项目、科技部重大研究计划课题等。已在PNAS、Gut、Annals of the Rheumatic Diseases、Genome Biology、Genome Medicine、Microbiome、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Nucleic Acids Research等生物学、医学和生物信息学顶级学术期刊发表学术论文100余篇,其中以第一作者或通讯作者发表SCI论文60余篇,文章总引用超过4000次,H指数30(Google Scholar)。获得软件著作权6项,申请国家发明专利20余项。担任Genomics Proteomics Bioinformatics、Microbiology Spectrum、Scientific Reports、iMeta等国际期刊编委。担任中国生物信息学学会-基因组信息学分会副主任,中国生物工程学会-计算生物学与生物信息学专业委员会委员,中国计算机协会-生物信息学专业委员会委员,中国遗传学会-生物大数据专业委员会委员,中国细胞生物学学会-功能基因组信息学与系统生物学分会-转化医学信息学学组专家委员等。担任英国生物技术与生物科学研究理事会(UK-BBSRC)等基金评委。教授“生物统计学”、“生物信息学”等课程,并是6届iGEM金牌团队的指导老师。

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http://www.microbioinformatics.org/

陈卫华

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研究方向是生物信息学,主要通过计算方法和多组数据集成来识别具有临床意义的基因和/或微生物物种,开发新的实验方法来操作它们,用于实际应用。研究组当前主要方向为:1. 人体(肠道、皮肤、消化道)菌群(细菌、真菌、噬菌体)与疾病和预后的关系研究,及功能和机制探索;2. 动物(反刍类)消化道(胃、大小肠)菌群与疾病、发育和关键性状关系研究,及功能和机制探索;3. 宏基因组功能挖掘;4. 细菌和噬菌体的基因改造,用于药物输送、癌症治疗和诊断;5. 菌群的精准调控及应用。

研究组主要是 dry lab,但与微生物实验室、临床医生、医院和企业有密切合作。研究组每年招收1~2名硕士生和1名博士生,至少招收1名博士后。申请人必须具备以下技能:1. Python (首选) 或 Perl;2. R;3. Linux 和排队系统,如 SLURM 或 QSUB;4. 使用 VueJS、MySQL 或流行框架进行网站和数据库开发。具有以下研究经验的优先考虑:宏基因组分析;噬菌体组分析。

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https://chenlab.medgenius.info/

薛宇

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薛宇,华中科技大学生命科学与技术学院教授、博士生导师。主要研究方向为蛋白质翻译后修饰的生物信息学。主持或参与多项国家自然科学基金、中科院和科技部973、重大研究计划等项目;以第一或通讯作者身份在Immunity、Nature Biomedical Engineering、Nature Communications、National Science Review、Nucleic Acids Research等期刊上发表SCI论文80余篇。2014年青年拔尖人才,2017年青年长江学者。担任Science Bulletin、Briefings in Bioinformatics、Genomics, Proteomics & Bioinformatics等期刊编委,并多次在国际会议上作特邀报告。

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https://www.biocuckoo.cn/

郭安源

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郭安源教授是国家优秀青年基金获得者,教育部新世纪优秀人才支持计划入选者、华中科技大学教授、博士生导师。课题组主要研究方向为开发生物信息学新方法和数据库,应用于癌症和细胞外囊泡等研究。以调控网络、肿瘤免疫和微泡外泌体的生物信息学研究为特色,从基因组学、转录组学、表观组学、单细胞测序等不同层面结合临床,系统研究癌症的分子机制,筛选疾病早期诊断和预后的分子靶标。近年来承担国家自然科学基金、科技部重点研发计划及企业合作项目等十数项。近五年在Advanced Science、Nucleic Acids Research、Cancer Research、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Theranostics、Oncogene等领域内权威期刊上发表SCI论文30余篇。实验室科研和生活氛围非常好,团结合作,实验室毕业生已有多名担任教授或副教授等职位。

周艳红

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研究领域:生物信息技术及其生物医学研究中的应用, 涉及基因组、转录组、蛋白质组相关信息的挖掘与利用,包括:基因及其表达调控、蛋白质结构与相互作用、基因功能及其与疾病相关性等的分析预测与实验验证等。 招生信息:接收本科生 5 - 7 人 / 年进行科研培训,招收硕士生、博士生 3 - 5 人 / 年,博士后 2 人。 论文与获奖情况: 2002 年以来主持国家自然科学基金等项目 10 余项 发表论文 60 余篇,出版专著 1 部,获软件著作版权 7 项 曾入选教育部新世纪优秀人才、湖北省青年杰出人才 曾获部级科技进步一等奖 2 项、二等奖 1 项。

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刘欣

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  • 1991.09-1995.07 武汉大学化学系理学学士
  • 1995.09-1998.07 武汉大学化学系理学硕士,专业:有机化学
  • 1998.09-2001.12 武汉大学化学系理学博士,专业:分析化学
  • 2004.10-2005.05 加拿大约克大学化学系博士后
  • 2005.06-2008.02 加拿大国家研究委员会生物科学所博士后/助理研究员
  • 2008.03-至今 华中科技大学生命科学与技术学院系统生物学系教授

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杜伟

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具有分析化学和生物学交叉学科研究的良好背景,在微流控生物分析领域开展了一系列前沿性研究。目前主要研究方向是建立基于微流控芯片的细胞生理与生化分析新技术平台,用于疾病诊断的生物分子传感器的构建及应用,以及高通量单细胞转录组分析。已在包括Biosens Bioelectron,Anal Chem,Lab chip, Sensor Actuat B-Chem等国际重要学术期刊杂志发表论文四十余篇。主持的科研项目有湖北省自然科学基金项目、4项国家自然科学基金项目、以及一项国家重点研发计划子课题等。

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冯晓均

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主要致力于微流控生物芯片及生物医学工程相关研究。采用微/纳加工技术(MEMS/NEMS),设计制作微流控生物芯片,亦称作“芯片实验室”(Lab-on-a-Chip),探索分子生物学、细胞生物学、生物医学工程及相关领域的前沿科学问题,研发面向应用的便携式医疗检测仪器。近年来主持及参与多项国家自然科学基金、国家863和国家973项目,已发表SCI收录论文 30余篇,其中第一作者及通讯作者论文10篇,单篇SCI影响因子IF > 10论文2 篇,SCI 他引百余次,已获得一项国际发明专利授权,已申请国家发明专利10余项。

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张礼斌

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  • 副教授 硕士生导师
  • 性别:男
  • 在职信息:在职
  • 所在单位:生命科学与技术学院
  • 学历:研究生(博士)毕业
  • 学位:博士学位
  • 毕业院校:武汉大学
  • 学科:生物化学与分子生物学

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陈鹏

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博士、华中科技大学生命与科学技术学院副教授,致力于微流控生物芯片与纳微尺度生物医学技术相关研究,针对“生物”国家战略性新兴产业与世界科技前沿,探索生物医学工程领域的前沿科学问题,研发面向单细胞分析、液体活检以及体外快速诊断的方法和仪器,近五年相关研究累计获批国家及省市各类基金六项,包括承担国家重点研发计划子课题、国自然青年基金,湖北省自然面上基金,博后特助和面上等基金。发表一作及通讯作者(含共一作或共通讯)SCI收录论文20余篇(其中IF>10,7篇),授权中国发明专利10余项,2022年度互联网+国赛银奖指导老师。

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